Российский государственный гуманитарный университет опровергает обвинения в нецелевом использовании денежных средств. Руководство утверждает, что более 70% от 156 миллионов рублей пошли на повышение зарплат преподавателям, что является важнейшей задачей, поставленной руководством страны. И только примерно третья часть названной суммы использована на зарплату административно-управленческому и вспомогательному персоналу университета.

Президент РФ Владимир Путин в сентябре 2012 года объявил выговор главам Минобрнауки, Минрегиона и Минтруда из-за невыполнения его майских указов. Выговор министру образования и науки был связан с ненадлежащим исполнением поручений президента по увеличению зарплат профессорско-преподавательскому составу.